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流行学习算法应用于基因芯片数据分析

矩阵D(dij)n*m运行在古典MDS上,寻找其低维构造点Y={y1,y2,…,yn}[5]。ISOMAP算法用残差E来衡量降维误差,即E=1-R2(DG,DY),这里DG为距离矩阵,DY是d维空间中欧氏距离矩阵,R2是线性相关系数。一般,降维维数d越高,E就越小。通过E曲线出现拐点或者E已经小到一定阈值就可以来确定降维的维数d[7]。1.3
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